Voici comment configurer Firefox pour qu'il n'active ces plugins que sur demande explicite de votre part:

• dans la barre d'adresse, tapez about:config
• dans la configuration, passez le paramètre "plugins.click_to_play" à "true".
  EDIT: Zut. Depuis Firefox 24, l'option plugins.click_to_play ne sert plus à rien. Il faut aller dans le menu Outils > Modules complémentaires > Plugins > et choisir "Demander pour activer" pour chaque plugin.